O CONPEP é o órgão consultivo e deliberativo da UFU nos âmbitos de pesquisa e pós-graduação. Algumas de suas competências são:

• Propor ao CONSUN diretrizes relativas a assuntos que envolvem pesquisa e/ou pós-graduação;
  
• Aprovar currículo dos cursos de pós-graduação da universidade, bem como alterações nestes;
  
• Elaborar seu regimento interno.
  
  

Alguns dos membros deste Conselho são: o Reitor (na função de presidente), o vice-Reitor, Coordenadores dos programas de pós-graduação stricto sensu, representantes técnico-administrativos portadores de título de pós-graduação stricto sensu e representantes discentes da pós-graduação desta modalidade.